我的叔叔有多处房产，他为了不交房产税与婶婶家的弟弟签了代名持有协议将房子转让给他，结果那个人在叔叔不知道的情况下将房子卖给了一个朋友，叔叔知道后很生气向法院起诉，法院却说这个朋友属于善意取得，原始取得是合法的，请问原始取得中居然包括善意取得吗？

包含的。
原始取得的特征之一就是是基于法律规定，而不是原所有者的意愿。善意取得就是基于法律规定而取得的，并不是以原权力者意愿而得，所以属于原始取得。善意取得四点特征，处分人是无权处分，第三人是善意且有偿取得。转让的财产必须完成交付或者登记。所占有的物决不能是脱离物。