企业签订股权抵债协议多年后，债权人仍未工商登记变更，也未与债务人平账，协议中所列欠款与实际有出入。请问这协议是否还有效

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首先需要明确，公司企业是不能持有股权的，在法定情形下可以从股东手中回购股权，但是之后需要注销并进行减资。
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其次，公司企业可以对外经营活动，可以对外负债，公司以全部法人财产对外承担责任，股东以出资额为限对外承担有限责任。
3.现在公司对外欠债，可以约定债务处理方式，合同相关内容可以自由约定，但是不得违反法律法规强制性规定。
4.如果公司企业没有持有其他公司企业股权，那么就没有抵债的股权基础，如果有，那么可以用来抵债，该企业应该履行协议约定，及时办理手续进行股权转让。否则，债权人可以提讼，要去履行协议进行股权转让。
5.可以搜集相关材料证据及时向提讼，防止两年诉讼时效经过。