我想问一下大学辅导员以帮助学生过级（英语，计算机，会计等）为由，让学生交钱报什么课程班，是不是一种不当行为，甚至是违法的

按照法律上来说，肯定是不可以的。
学校的宿舍是学生缴纳了宿舍费用后，学校租赁给学生的。你们寝室的人员可以自由出入以外，其他人都不能自由出入你们寝室，除非在寝室人员同意的情况下，才能进入寝室。
如果你们寝室丢了什么东西，你们可以直接报警，因为你们辅导员有钥匙（被怀疑对象肯定有他或者她）。你们对你们辅导员说，我们丢了东西就找你，因为你可以趁我们不在的时候进我们寝室。叫他把钥匙交出来，他不交，请打110。（这个属于一般的方法）
如果你们想玩玩你们辅导员，在你们寝室人都在或者都不在的情况，在门上放个的东西（用水之类的混合液体）用烟灰烟头什么的混合物体，是比较好的选择，寝室里肯定有的东西。（这个属于恶搞，辅导员如果中招，够你们笑一年的了）
如果要强硬一点的话，直接跟你们辅导员明说，我们平平安安毕业，那么你也就没事。