夫妻两个共同财产，分居三年后，个人所得算夫妻共同财

您好，首先需要确定的是，在婚姻关系存续期间，双方分居后，您双方有无约定，约定在分居期间的个人所得归个人所有。
1、如果有这样的约定，那么就尊重夫妻双方的婚内约定，在分割夫妻共同财产时，会尊重约定。
2、如果双方在婚内没有特殊的约定，那么双方虽然分居，但依然处于婚姻的存续期间，所以个人所得依旧属于夫妻共同财产。
3、综上所述，是否是夫妻共同财产不取决于您二者是否分居，取决于您二者是否有有效的婚内财产约定存在。