根据我国《个人所得税法》及其实施条例的规定，自然人股东的股权转让所得应按财产转让所得项目征收个人所得税，适用20的税率。为了加强自然人股东股权转让所得个人所得税的征收管理，提高征管质量和效率，堵塞征管漏洞，国家税务总局在2009年5月28日下发了《关于加强股权转让所得征收个人所得税管理的通知》(国税函〔2009〕285号)。该文件明确，税务机关应加强对股权转让所得计税依据的评估和审核。对扣缴义务人或纳税人申报的股权转让所得相关资料应认真审核，判断股权转让行为是否符合交易原则，是否符合合理性经济行为及实际情况。对申报的计税依据明显偏低(如平价和低价转让等)且无正当理由的，主管税务机关可参照每股净资产或个人股东享有的股权比例所对应的净资产份额核定。对于自然人股东将股权赠与他人是否需要缴纳个人所得税，我国税收法规尚无明确规定。根据“法无明文规定即无权”的法律原则，自然人股东将股权赠与他人不需要缴纳个人所得税。也就是说，如果自然人股东是低价或平价转让股权，税务机关可以根据企业净资产情况及股东的股权比例核定其计税依据，但如果自然人股东是将股权赠与他人，无论是赠与人还是受赠人都无需缴纳个人所得税.
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