司法鉴定文书只加盖单位机构公章，没有加盖公章司法鉴定

有瑕疵。
《司法鉴定程序通则》第三十八条规定：司法鉴定意见书应当加盖司法鉴定机构的司法鉴定专用章。
第四十一条规定，司法鉴定意见书出具后，发现有下列情形之一的，司法鉴定机构可以进行补正：
(一)图像、谱图、表格不清晰的;
(二)签名、盖章或者编号不符合制作要求的;
(三)文字表达有瑕疵或者错别字，但不影响司法鉴定意见的。
补正应当在原司法鉴定意见书上进行，由至少一名司法鉴定人在补正处签名。必要时，可以出具补正书。
对司法鉴定意见书进行补正，不得改变司法鉴定意见的原意。