我是一家公司的财务，公司里的一个部门经理卷款潜逃，这是公司的备用金，当然被公司告上了法庭，当时是检察院直接刑事拘留了，想了解下检察院是可以这么做的吗？

可以。检察院对直接受理的案件，需要逮捕、拘留犯罪嫌疑人的，由人民检察院作出决定可以由检察院直接刑事拘留，但由公安机关执行。
相关法律规定：
《刑事诉讼法》第一百六十二条 人民检察院对直接受理的案件的侦查适用本章规定。
第一百六十三条 人民检察院直接受理的案件中符合本法第七十九条、第八十条第四项、第五项规定情形，需要逮捕、拘留犯罪嫌疑人的，由人民检察院作出决定，由公安机关执行。
第一百六十四条 人民检察院对直接受理的案件中被拘留的人，应当在拘留后的二十四小时以内进行讯问。在发现不应当拘留的时候，必须立即释放，发给释放证明。
第一百六十五条 人民检察院对直接受理的案件中被拘留的人，认为需要逮捕的，应当在十四日以内作出决定。在特殊情况下，决定逮捕的时间可以延长一日至三日。对不需要逮捕的，应当立即释放；对需要继续侦查，并且符合取保候审、监视居住条件的，依法取保候审或者监视居住。