你好，我是一家公司财务，我公司投资设立了一家网络公司，开发一件应用APP，前期投入大量的人务物力，现在差不多成品了，研发人员叫我们后勤要去做个软著申请，专利代办公司问是申请软件著作还是软件专利，我搞不明白这个，想咨询下专利著作权保护计算机软件专利有什么区别呢？

区别如下：
1、保护原则不同
软件著作权是在软件创作完成后自动产生的，也是自愿进行软件著作权登记，登记的目的是体现公证的效力，主要用于声明著作权权属，同时使后续维权时的证据力度更大。
软件专利则必须向专利局提出申请才能获得保护，因此必须要积极申请，且专利制度也是以“用公开换保护”为原则。
2、保护依据不同
软件著作权保护依据是《著作权法》和《计算机软件保护条例》。软件专利保护依据是《专利法》，具体审查标准参见国家知识产权局专利《审查指南》第二部分第九章“涉及计算机程序的发明专利申请审查若干问题”。
3、保护客体不同
软件著作权申请提交的资料是源代码及用户操作手册，所以软件著作权保护的是表现形式，不保护思想。这样就有可能出现竞争对手将你的软件进行研究，然后改变编程语言，达到的结果是一样的，但由于代码不相同，所以不侵犯著作权。
软件专利则不同，在申请时描述的是软件的设计构思（注意一定要以技术方案的形式表现，或者最好能够结合硬件来表现），包含了软件流程图的内容，而不是主要说明采用哪种程序语言实现。一旦获权后，他人只要采用了软件专利的设计构思或方案，就可能构成侵权。
4、通过率不同
软件著作权实行的是登记制，一般不需要经过实质审查，只要形式审查时提交的材料符合要求，并且不违反《著作权法》的规定即可获权，登记通过率极高。
软件专利需要经过形式审查和实际审查。一般纯软件型的专利不易获权，通过软硬件结合的方式会提高其授权率，但总得来说通过率依然不高。
5、保护期限不同
民的作品，其法律规定的相关著作权保护期为作者有生之年加死亡后50年；法人及其它组织的作品，其法律规定的相关著作权的保护期为50年。
软件专利只能申请发明专利，保护期限从申请日起算20年。